運送業許可申請時には運行管理者、整備管理者、運転者は雇用していなければならないか

新規許可申請時に雇用していないといけないのか？

これはきっと全運輸局共通だと思います。

雇っていなければいけない、と書いてあるホームページもありますがそんなことないので安心してください。

新規許可申請の際に雇っていないといけないとなると、申請から許可まで４～５か月の間、どうやってお給料払うのでしょうね。

雇用してなくても「いついつまでに雇う予定です」くらいの計画で大丈夫です。

運転者名簿はだから「確保予定」というチェック欄もありますね。

運行管理者とかの就任承諾書を添付する運輸局については運輸開始前確認くらいで出すのでしょうね。